认识 Rosalind Workbench：赋能每位科学家成为自己的研究团队
碎片化的数据、互不连通的工具以及不清晰的实验记录会妨碍科学研究：数据可能在一个地方，分析在另一个地方，而结果如何产生的记录又在别处。遵循证据意味着，在决定下一步研究什么时，要让这些部分保持关联。
这就是我们构建 Rosalind Workbench 的原因——将这些工作整合到一个环境中。
它为生命科学用户提供了一个中心环境，用于利用他们喜爱的科学工具、探索新的专业生物学模型，并定义他们最常用的数据分析工作流。这个虚拟工作台提供了一种引导式体验，帮助科学家充分利用前沿模型和最先进的科学工具，以加速他们的研究。
Rosalind Workbench 现已通过 ChatGPT 应用提供研究预览， 研究人员可以在其中尝试引导式科学任务，并将其调整为自己的 数据、方法和研究目标。
Rosalind Workbench 基于 GPT-Rosalind 构建，这是我们专用的生命科学模型，它将前沿推理与药物化学、基因组学、湿实验辅助及其他科学应用中的专业工具编排相结合。随着时间的推移，我们设想由多个智能体组成的团队在这些领域协同工作，让研究人员能够获得更广泛的专业知识，并有能力追求更宏大的科学问题。
探索科学工作流
不同学科使用不同的数据和方法，但潜在的需求往往是相同的：将生物学问题与正确的证据联系起来，并明确通向下一个决策的路径。
研究很少能整齐地纳入单一工具中——以一个关于疾病机制的问题为例：它可能始于一个基因组信号，引向一个分子结构，需要文献中的证据，并以一个新的实验设计告终。每一步都使用不同的数据和方法，但它仍然需要回答同一个生物学问题。
Rosalind Workbench 有助于连接这些部分：你可以从一个引导式示例开始，了解什么是可能的，然后将该方法调整为你的数据、方法和研究目标。每个示例都展示了生物学问题如何在专业工具中推进，同时计划、中间结果和支持证据保持关联。
探索分子蛋白质结构
在这个示例中，一位科学家研究与司美格鲁肽结合的 GLP1R 的结构。他们指示模型与查看器交互，解释 PDB 文件中的结构特征，并创建一个展示蛋白质复合物关键特征的影片。
检验证据
专业查看器让你能够在与分析相同的对话中检查科学数据。你可以检查细节、提出后续问题，并将所见内容与分析保持关联。
开始使用 Rosalind Workbench
要尝试这些工作流，请在 ChatGPT 应用中打开 Rosalind Workbench 并按照引导式入门流程操作。
1. 从一个生物学问题开始
入门屏幕提供涵盖蛋白质设计、小分子设计、安全性与可开发性、结构与序列、基因组学与病理学以及实验验证的研究任务。您可以选择一项任务，或探索可用的科学工具。
2. 连接专用科学工具
下一步取决于问题本身。例如，设计 PD-L1 纳米抗体的研究人员可以对主要候选物进行排序，然后使用实验验证任务来规划并估算五个纳米抗体的结合测定费用。从事小分子研究的研究人员可以将伊马替尼对接到 ABL1 中，查看前五个主要构象，并在分子结构工具中检查由此产生的相互作用。
同样，地塞米松处理的气道 RNA-seq 任务为基因组学研究人员在 NGS 分析工作台中提供了一个起点，并将生物学问题附加到分析中。
这些任务展示了设计、分析、检查和验证如何共享同一研究目标。引导式工作流减少了在工具之间切换所需的设置工作，从而留出更多时间来思考生物学问题并审查证据。
3. 为您的基因组学研究运行引导式研究工作流
测序分析通常需要许多相互关联的决策和数据集，然后才能解释生物学结果。文件必须与元数据匹配，必须评估质量，必须识别正确的生物学重复，并且必须选择适当的统计设计。
Rosalind NGS 工作台帮助将这些步骤连接到一个可审查的流程中。
从测序数据到研究决策
从 FASTQ 输入到质量控制、批量 RNA-seq 或单细胞分析，Rosalind 会制定一份供研究人员批准的计划，协调所选工具，并返回可追溯、可审查的结果。
探索 Rosalind 工作台
无论您如何开始，目标都是一样的：从研究问题出发，获得您可以检查的证据，并清晰记录工作是如何完成的以及接下来可以探索什么。
高级生命科学研究既需要复杂的推理，也需要适合敏感生物学信息的保障措施。Rosalind 工作台中的 ChatGPT 代理支持两种模式：
探索模式：提出一般性科学问题，并使用您可用的 ChatGPT 模型探索想法。
研究模式：处理更复杂的生物学问题、深入分析和高级研究工作流。经过验证的组织成员可以代表其组织申请访问权限。个人访问权限即将推出。
将研究的每个部分汇集在一起
研究常常在步骤之间的间隙中慢下来。数据存放在一个地方，分析在别处进行，而结果背后的方法可能难以追踪。研究人员花费太多时间等待交接、重建上下文，并弄清楚发生了什么，然后才能决定下一步做什么。
将问题、工具、分析和证据集中在一处，使这些过渡更容易追踪。使用 Rosalind 工作台，您可以审查重要的选择，追踪结果是如何产生的，并从一个步骤进入下一个步骤，而无需重新开始或丢失线索。这意味着用于协调工作的时间更少，用于决定证据说明了什么以及接下来测试什么的时间更多。
获取访问权限
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